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尊龙凯时MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30助力甲基化研究,提升数据利用率!

发布时间:2025-01-31   信息来源:尊龙凯时官方编辑

近期,尊龙凯时针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出了新一代的建库产品——MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasy Whole Genome Methylation Sequencing Library Prep Kit V30,以下简称WGMSV30)。此款WGMSV30建库采用双链加接头的方法,针对通过物理打断获得的DNA片段进行建库,并结合酶法转化,将非甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。搭配DNBSEQ平台,WGMSV30可以以单碱基精度解析DNA的甲基化状态,从而构建精细的全基因组甲基化图谱。

尊龙凯时MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30助力甲基化研究,提升数据利用率!

WGMSV30为多个领域提供了高效、准确的全基因组甲基化建库解决方案,这些领域包括大人群的表观组研究、表观遗传基础科学研究、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选以及药物研发等。目前,WGMSV30已适配MGISEQ-2000平台,结合MGISEQ-2000平台的升级算法,在测序过程中无需添加平衡文库,实现了0平衡文库的纯甲基化文库测序。此外,尊龙凯时研发团队正在针对WGMSV30适配DNBSEQ-T7平台进行最后的稳定性测试,更多实测数据将持续分享,敬请期待。

在采用三个不同批次的WGMSV30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库时,未添加平衡文库,并平行在MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂)上进行测序,结果显示PE150测序的单lane reads产出基本稳定在400M左右,单个文库可获得约120G的原始数据,轻松实现“1库1lane”的需求。此外,测序质量也表现良好:SM测序试剂Q30稳定在89%左右,而SM20测序试剂Q30则稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右(详细数据见相关文献)。Read1和Read2的测序碱基分布线几乎保持稳定,进一步证明了测序质量的优越性。

WGMSV30试剂盒采用了对转化损伤小的酶法转化,扩大了文库插入片段长度,显著提升了PE150测序的支持能力。不同批次的建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库插入片段主峰一致,约为280bp。试剂盒也优化了末端修复反应的体系与步骤,降低了Reads末端M-bias碱基个数。使用SM20版测序试剂和ECR71软件版本所获得的结果显示,不同批次的建库结果在M-bias表现上趋于一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1与Read2的甲基化率几乎重合。